Вы имеете в виду перманентный аудит? Тогда, видимо, имеет смысл вводить в штат аудитора-специалиста в узкоспециальной области. Опять же, заполучить его лучше навсегда - либо взяв со стороны, либо вырастив из персонала смежных структур. Но не ротацией!
В моей Компании нет такой проблемы - обычно задача ставится и выполняется в рамках конкретных сроков, и пролонгация ее возможна только в случае постконтрольных мероприятий по проекту. Даже если сроки в сумме затягиваются на год, то эксперты узкоспециальных подразделений обычно не отказывают в милости и сопровождают задачу. В разумных пределах, разумеется.